Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem52bQ0VBF2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem52bQ0VBF2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1279 ms