Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntnap5aQ0V8T9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntnap5aQ0V8T9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5aQ0V8T9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms