Protein–RNA interactions for Protein: Q08642

Padi2, Protein-arginine deiminase type-2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi2Q08642 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Padi2Q08642 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Padi2Q08642 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Padi2Q08642 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Padi2Q08642 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Padi2Q08642 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Padi2Q08642 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Padi2Q08642 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Padi2Q08642 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Padi2Q08642 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Padi2Q08642 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Padi2Q08642 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Padi2Q08642 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Padi2Q08642 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Padi2Q08642 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Padi2Q08642 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms