Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YER137CYER137C 447 nt7.47□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 YML122CYML122C 381 nt7.47□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 SCS22YBL091C-A 528 nt7.47□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 MNN9YPL050C 1188 nt7.47□□□□□ -1.21
SGO1Q08490 YLR162WYLR162W 357 nt7.46□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 SWP1YMR149W 861 nt7.46□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 NFS1YCL017C 1494 nt7.46□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 ALG7YBR243C 1347 nt7.46□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 YKR018CYKR018C 2178 nt7.46□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 BUD31YCR063W 474 nt7.45□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 STF1YDL130W-A 261 nt7.45□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 DST1YGL043W 930 nt7.45□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 YJL211CYJL211C 444 nt7.45□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 YKL153WYKL153W 510 nt7.45□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 DPM1YPR183W 804 nt7.45□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 CBK1YNL161W 2271 nt7.45□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 DML1YMR211W 1428 nt7.44□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 MDH1YKL085W 1005 nt7.44□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 BNA3YJL060W 1335 nt7.44□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 MSB3YNL293W 1902 nt7.44□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 INO1YJL153C 1602 nt7.43□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 YGR137WYGR137W 375 nt7.43□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 EEB1YPL095C 1371 nt7.43□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 CDC13YDL220C 2775 nt7.42□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 SNP1YIL061C 903 nt7.42□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 SRN2YLR119W 642 nt7.42□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 PMT1YDL095W 2454 nt7.42□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 FCP1YMR277W 2199 nt7.42□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 SKP1YDR328C 585 nt7.41□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 MGM101YJR144W 810 nt7.41□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 DSC3YOR223W 879 nt7.41□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 YPT10YBR264C 600 nt7.41□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 CMK2YOL016C 1344 nt7.41□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 RSC9YML127W 1746 nt7.41□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 PPZ2YDR436W 2133 nt7.4□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 OPI1YHL020C 1215 nt7.4□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 INM1YHR046C 888 nt7.4□□□□□ -1.22
SGO1Q08490 YDR387CYDR387C 1668 nt7.4□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 YOL046CYOL046C 675 nt7.39□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 LIA1YJR070C 978 nt7.38□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 HOC1YJR075W 1191 nt7.38□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 TDA4YJR116W 840 nt7.38□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 PRB1YEL060C 1908 nt7.37□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 GPD1YDL022W 1176 nt7.37□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 FYV1YDR024W 486 nt7.37□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt7.37□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 YCL049CYCL049C 939 nt7.37□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 TGL5YOR081C 2250 nt7.37□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 GUT1YHL032C 2130 nt7.37□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 MRPL19YNL185C 477 nt7.36□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 KTR4YBR199W 1395 nt7.35□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 SSC1YJR045C 1965 nt7.35□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 GET2YER083C 858 nt7.35□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 BMT5YIL096C 1011 nt7.35□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 YPR130CYPR130C 408 nt7.35□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 COX15YER141W 1461 nt7.35□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 YJL163CYJL163C 1668 nt7.35□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 PDC5YLR134W 1692 nt7.35□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 SEC24YIL109C 2781 nt7.34□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 MRPL35YDR322W 1104 nt7.34□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 YPL277CYPL277C 1464 nt7.34□□□□□ -1.23
SGO1Q08490 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.33□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 HMT1YBR034C 1047 nt7.33□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 PPS1YBR276C 2424 nt7.33□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 MAL31YBR298C 1845 nt7.32□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 YPQ2YDR352W 954 nt7.32□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 MRP7YNL005C 1116 nt7.32□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt7.31□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 DRE2YKR071C 1047 nt7.31□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 TOD6YBL054W 1578 nt7.31□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.31□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 YBL112CYBL112C 318 nt7.31□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 RMD8YFR048W 1989 nt7.31□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 AGX1YFL030W 1158 nt7.3□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 PZF1YPR186C 1290 nt7.3□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 TPO1YLL028W 1761 nt7.3□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 RBS1YDL189W 1374 nt7.3□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 AOS1YPR180W 1044 nt7.29□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 AVL9YLR114C 2295 nt7.29□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 RUP1YOR138C 2016 nt7.28□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 PEX28YHR150W 1740 nt7.28□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 CIA1YDR267C 993 nt7.28□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.28□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 YJL213WYJL213W 996 nt7.28□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 YPR076WYPR076W 375 nt7.28□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 TUB1YML085C 1344 nt7.27□□□□□ -1.24
SGO1Q08490 MAK32YCR019W 1092 nt7.27□□□□□ -1.25
SGO1Q08490 IMG1YCR046C 510 nt7.27□□□□□ -1.25
SGO1Q08490 CKB1YGL019W 837 nt7.27□□□□□ -1.25
SGO1Q08490 SNA3YJL151C 402 nt7.27□□□□□ -1.25
SGO1Q08490 HAM1YJR069C 594 nt7.27□□□□□ -1.25
SGO1Q08490 YOR041CYOR041C 432 nt7.27□□□□□ -1.25
SGO1Q08490 ILV6YCL009C 930 nt7.27□□□□□ -1.25
SGO1Q08490 MTC6YHR151C 1581 nt7.26□□□□□ -1.25
SGO1Q08490 GNA1YFL017C 480 nt7.26□□□□□ -1.25
SGO1Q08490 CCW12YLR110C 402 nt7.26□□□□□ -1.25
SGO1Q08490 YOR389WYOR389W 1875 nt7.26□□□□□ -1.25
SGO1Q08490 BDS1YOL164W 1941 nt7.25□□□□□ -1.25
SGO1Q08490 PPH21YDL134C 1110 nt7.25□□□□□ -1.25
SGO1Q08490 YHR033WYHR033W 1272 nt7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 372.5 ms