RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q08490
SGO1, Shugoshin, yeast
Predictions only
Length
590 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SGO1
Q08490
YER137C
YER137C
447 nt
7.47
□□□□□ -1.21
SGO1
Q08490
YML122C
YML122C
381 nt
7.47
□□□□□ -1.21
SGO1
Q08490
SCS22
YBL091C-A
528 nt
7.47
□□□□□ -1.21
SGO1
Q08490
MNN9
YPL050C
1188 nt
7.47
□□□□□ -1.21
SGO1
Q08490
YLR162W
YLR162W
357 nt
7.46
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
SWP1
YMR149W
861 nt
7.46
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
NFS1
YCL017C
1494 nt
7.46
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
ALG7
YBR243C
1347 nt
7.46
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
YKR018C
YKR018C
2178 nt
7.46
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
BUD31
YCR063W
474 nt
7.45
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
STF1
YDL130W-A
261 nt
7.45
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
DST1
YGL043W
930 nt
7.45
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
YJL211C
YJL211C
444 nt
7.45
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
YKL153W
YKL153W
510 nt
7.45
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
DPM1
YPR183W
804 nt
7.45
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
CBK1
YNL161W
2271 nt
7.45
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
DML1
YMR211W
1428 nt
7.44
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
MDH1
YKL085W
1005 nt
7.44
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
BNA3
YJL060W
1335 nt
7.44
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
MSB3
YNL293W
1902 nt
7.44
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
INO1
YJL153C
1602 nt
7.43
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
YGR137W
YGR137W
375 nt
7.43
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
EEB1
YPL095C
1371 nt
7.43
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
CDC13
YDL220C
2775 nt
7.42
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
SNP1
YIL061C
903 nt
7.42
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
SRN2
YLR119W
642 nt
7.42
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
PMT1
YDL095W
2454 nt
7.42
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
FCP1
YMR277W
2199 nt
7.42
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
SKP1
YDR328C
585 nt
7.41
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
MGM101
YJR144W
810 nt
7.41
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
DSC3
YOR223W
879 nt
7.41
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
YPT10
YBR264C
600 nt
7.41
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
CMK2
YOL016C
1344 nt
7.41
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
RSC9
YML127W
1746 nt
7.41
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
PPZ2
YDR436W
2133 nt
7.4
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
OPI1
YHL020C
1215 nt
7.4
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
INM1
YHR046C
888 nt
7.4
□□□□□ -1.22
SGO1
Q08490
YDR387C
YDR387C
1668 nt
7.4
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
YOL046C
YOL046C
675 nt
7.39
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
LIA1
YJR070C
978 nt
7.38
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
HOC1
YJR075W
1191 nt
7.38
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
TDA4
YJR116W
840 nt
7.38
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
PRB1
YEL060C
1908 nt
7.37
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
GPD1
YDL022W
1176 nt
7.37
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
FYV1
YDR024W
486 nt
7.37
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
YIR018C-A
YIR018C-A
138 nt
7.37
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
YCL049C
YCL049C
939 nt
7.37
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
TGL5
YOR081C
2250 nt
7.37
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
GUT1
YHL032C
2130 nt
7.37
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
MRPL19
YNL185C
477 nt
7.36
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
KTR4
YBR199W
1395 nt
7.35
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
SSC1
YJR045C
1965 nt
7.35
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
GET2
YER083C
858 nt
7.35
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
BMT5
YIL096C
1011 nt
7.35
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
YPR130C
YPR130C
408 nt
7.35
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
COX15
YER141W
1461 nt
7.35
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
YJL163C
YJL163C
1668 nt
7.35
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
PDC5
YLR134W
1692 nt
7.35
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
SEC24
YIL109C
2781 nt
7.34
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
MRPL35
YDR322W
1104 nt
7.34
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
YPL277C
YPL277C
1464 nt
7.34
□□□□□ -1.23
SGO1
Q08490
YIL029W-A
YIL029W-A
372 nt
7.33
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
HMT1
YBR034C
1047 nt
7.33
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
PPS1
YBR276C
2424 nt
7.33
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
MAL31
YBR298C
1845 nt
7.32
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
YPQ2
YDR352W
954 nt
7.32
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
MRP7
YNL005C
1116 nt
7.32
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
YHR218W-A
YHR218W-A
318 nt
7.31
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
DRE2
YKR071C
1047 nt
7.31
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
TOD6
YBL054W
1578 nt
7.31
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
YNR001W-A
YNR001W-A
219 nt
7.31
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
YBL112C
YBL112C
318 nt
7.31
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
RMD8
YFR048W
1989 nt
7.31
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
AGX1
YFL030W
1158 nt
7.3
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
PZF1
YPR186C
1290 nt
7.3
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
TPO1
YLL028W
1761 nt
7.3
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
RBS1
YDL189W
1374 nt
7.3
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
AOS1
YPR180W
1044 nt
7.29
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
AVL9
YLR114C
2295 nt
7.29
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
RUP1
YOR138C
2016 nt
7.28
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
PEX28
YHR150W
1740 nt
7.28
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
CIA1
YDR267C
993 nt
7.28
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
YGR068W-A
YGR068W-A
96 nt
7.28
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
YJL213W
YJL213W
996 nt
7.28
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
YPR076W
YPR076W
375 nt
7.28
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
TUB1
YML085C
1344 nt
7.27
□□□□□ -1.24
SGO1
Q08490
MAK32
YCR019W
1092 nt
7.27
□□□□□ -1.25
SGO1
Q08490
IMG1
YCR046C
510 nt
7.27
□□□□□ -1.25
SGO1
Q08490
CKB1
YGL019W
837 nt
7.27
□□□□□ -1.25
SGO1
Q08490
SNA3
YJL151C
402 nt
7.27
□□□□□ -1.25
SGO1
Q08490
HAM1
YJR069C
594 nt
7.27
□□□□□ -1.25
SGO1
Q08490
YOR041C
YOR041C
432 nt
7.27
□□□□□ -1.25
SGO1
Q08490
ILV6
YCL009C
930 nt
7.27
□□□□□ -1.25
SGO1
Q08490
MTC6
YHR151C
1581 nt
7.26
□□□□□ -1.25
SGO1
Q08490
GNA1
YFL017C
480 nt
7.26
□□□□□ -1.25
SGO1
Q08490
CCW12
YLR110C
402 nt
7.26
□□□□□ -1.25
SGO1
Q08490
YOR389W
YOR389W
1875 nt
7.26
□□□□□ -1.25
SGO1
Q08490
BDS1
YOL164W
1941 nt
7.25
□□□□□ -1.25
SGO1
Q08490
PPH21
YDL134C
1110 nt
7.25
□□□□□ -1.25
SGO1
Q08490
YHR033W
YHR033W
1272 nt
7.25
□□□□□ -1.25
First
Previous
11
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 372.5 ms