Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff1Q08423 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff1Q08423 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff1Q08423 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tff1Q08423 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tff1Q08423 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms