Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrstQ06666 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrstQ06666 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrstQ06666 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrstQ06666 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SrstQ06666 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrstQ06666 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrstQ06666 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrstQ06666 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrstQ06666 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms