Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prrx2Q06348 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prrx2Q06348 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms