Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pfdn6Q03958 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pfdn6Q03958 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pfdn6Q03958 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn6Q03958 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms