Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha4Q03137 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha4Q03137 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha4Q03137 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms