Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrkczQ02956 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrkczQ02956 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrkczQ02956 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PrkczQ02956 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrkczQ02956 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrkczQ02956 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms