Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga4Q00651 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itga4Q00651 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms