Protein–RNA interactions for Protein: P97766

Cfc1, Cryptic protein, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfc1P97766 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfc1P97766 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfc1P97766 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfc1P97766 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfc1P97766 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfc1P97766 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfc1P97766 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfc1P97766 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfc1P97766 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfc1P97766 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfc1P97766 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfc1P97766 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfc1P97766 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfc1P97766 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfc1P97766 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms