Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
rp9P97762 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
rp9P97762 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
rp9P97762 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
rp9P97762 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
rp9P97762 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
rp9P97762 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
rp9P97762 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
rp9P97762 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
rp9P97762 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
rp9P97762 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
rp9P97762 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
rp9P97762 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
rp9P97762 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
rp9P97762 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
rp9P97762 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
rp9P97762 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
rp9P97762 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
rp9P97762 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
rp9P97762 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
rp9P97762 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
rp9P97762 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
rp9P97762 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
rp9P97762 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
rp9P97762 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
rp9P97762 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
rp9P97762 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
rp9P97762 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
rp9P97762 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
rp9P97762 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
rp9P97762 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
rp9P97762 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
rp9P97762 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
rp9P97762 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
rp9P97762 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
rp9P97762 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
rp9P97762 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
rp9P97762 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
rp9P97762 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
rp9P97762 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
rp9P97762 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
rp9P97762 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
rp9P97762 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
rp9P97762 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
rp9P97762 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
rp9P97762 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
rp9P97762 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
rp9P97762 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
rp9P97762 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
rp9P97762 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
rp9P97762 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
rp9P97762 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
rp9P97762 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
rp9P97762 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
rp9P97762 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
rp9P97762 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
rp9P97762 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
rp9P97762 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
rp9P97762 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
rp9P97762 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
rp9P97762 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
rp9P97762 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
rp9P97762 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
rp9P97762 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
rp9P97762 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
rp9P97762 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
rp9P97762 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
rp9P97762 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
rp9P97762 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
rp9P97762 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
rp9P97762 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
rp9P97762 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
rp9P97762 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
rp9P97762 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
rp9P97762 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
rp9P97762 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
rp9P97762 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
rp9P97762 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
rp9P97762 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
rp9P97762 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
rp9P97762 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
rp9P97762 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
rp9P97762 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
rp9P97762 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
rp9P97762 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
rp9P97762 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
rp9P97762 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
rp9P97762 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
rp9P97762 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
rp9P97762 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
rp9P97762 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
rp9P97762 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
rp9P97762 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
rp9P97762 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
rp9P97762 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
rp9P97762 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
rp9P97762 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
rp9P97762 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
rp9P97762 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
rp9P97762 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms