Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx3P81067 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Irx3P81067 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Irx3P81067 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Irx3P81067 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irx3P81067 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Irx3P81067 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irx3P81067 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irx3P81067 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Irx3P81067 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Irx3P81067 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Irx3P81067 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Irx3P81067 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms