Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Polr1bP70700 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1bP70700 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1bP70700 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms