Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp4P70343 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp4P70343 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp4P70343 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp4P70343 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp4P70343 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp4P70343 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp4P70343 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp4P70343 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Casp4P70343 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp4P70343 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp4P70343 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp4P70343 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp4P70343 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp4P70343 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp4P70343 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms