Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbpl1P62340 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbpl1P62340 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbpl1P62340 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbpl1P62340 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms