Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Depdc5P61460 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Depdc5P61460 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Depdc5P61460 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Depdc5P61460 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Depdc5P61460 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Depdc5P61460 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Depdc5P61460 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Depdc5P61460 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Depdc5P61460 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Depdc5P61460 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Depdc5P61460 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Depdc5P61460 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Depdc5P61460 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Depdc5P61460 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Depdc5P61460 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Depdc5P61460 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Depdc5P61460 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Depdc5P61460 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Depdc5P61460 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Depdc5P61460 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Depdc5P61460 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Depdc5P61460 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Depdc5P61460 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Depdc5P61460 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Depdc5P61460 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Depdc5P61460 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Depdc5P61460 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Depdc5P61460 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Depdc5P61460 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Depdc5P61460 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Depdc5P61460 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Depdc5P61460 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Depdc5P61460 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Depdc5P61460 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Depdc5P61460 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Depdc5P61460 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Depdc5P61460 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Depdc5P61460 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Depdc5P61460 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Depdc5P61460 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Depdc5P61460 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Depdc5P61460 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Depdc5P61460 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Depdc5P61460 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Depdc5P61460 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Depdc5P61460 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Depdc5P61460 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Depdc5P61460 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms