Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snap25P60879 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snap25P60879 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snap25P60879 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Snap25P60879 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snap25P60879 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snap25P60879 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snap25P60879 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Snap25P60879 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Snap25P60879 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snap25P60879 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms