Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TdgP56581 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TdgP56581 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TdgP56581 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TdgP56581 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TdgP56581 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TdgP56581 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TdgP56581 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TdgP56581 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TdgP56581 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TdgP56581 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TdgP56581 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TdgP56581 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TdgP56581 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TdgP56581 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TdgP56581 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TdgP56581 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TdgP56581 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TdgP56581 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TdgP56581 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TdgP56581 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TdgP56581 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TdgP56581 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TdgP56581 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TdgP56581 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TdgP56581 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TdgP56581 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TdgP56581 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TdgP56581 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TdgP56581 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TdgP56581 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TdgP56581 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TdgP56581 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TdgP56581 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TdgP56581 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TdgP56581 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TdgP56581 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TdgP56581 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TdgP56581 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TdgP56581 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TdgP56581 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TdgP56581 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TdgP56581 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TdgP56581 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TdgP56581 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TdgP56581 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TdgP56581 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TdgP56581 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TdgP56581 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TdgP56581 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TdgP56581 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TdgP56581 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TdgP56581 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TdgP56581 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TdgP56581 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TdgP56581 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TdgP56581 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TdgP56581 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TdgP56581 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TdgP56581 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TdgP56581 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TdgP56581 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TdgP56581 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TdgP56581 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TdgP56581 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TdgP56581 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TdgP56581 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TdgP56581 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TdgP56581 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TdgP56581 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TdgP56581 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TdgP56581 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TdgP56581 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TdgP56581 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TdgP56581 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TdgP56581 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TdgP56581 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TdgP56581 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TdgP56581 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TdgP56581 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TdgP56581 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TdgP56581 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TdgP56581 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TdgP56581 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TdgP56581 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TdgP56581 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TdgP56581 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TdgP56581 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TdgP56581 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TdgP56581 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TdgP56581 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TdgP56581 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TdgP56581 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TdgP56581 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TdgP56581 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TdgP56581 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TdgP56581 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TdgP56581 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TdgP56581 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TdgP56581 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms