Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa11P50709 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa11P50709 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa11P50709 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms