Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa11P50709 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa11P50709 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa11P50709 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa11P50709 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa11P50709 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa11P50709 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms