Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc13P50207 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc13P50207 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc13P50207 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc13P50207 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms