Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms