Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli1P47806 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gli1P47806 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gli1P47806 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gli1P47806 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gli1P47806 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gli1P47806 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gli1P47806 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gli1P47806 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gli1P47806 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli1P47806 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli1P47806 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli1P47806 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli1P47806 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms