Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdkn1bP46414 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdkn1bP46414 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms