Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Casp1P29452 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Casp1P29452 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Casp1P29452 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Casp1P29452 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Casp1P29452 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Casp1P29452 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Casp1P29452 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Casp1P29452 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Casp1P29452 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Casp1P29452 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Casp1P29452 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Casp1P29452 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Casp1P29452 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Casp1P29452 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Casp1P29452 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Casp1P29452 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Casp1P29452 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Casp1P29452 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Casp1P29452 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Casp1P29452 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Casp1P29452 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Casp1P29452 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Casp1P29452 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Casp1P29452 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Casp1P29452 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Casp1P29452 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Casp1P29452 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Casp1P29452 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Casp1P29452 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Casp1P29452 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Casp1P29452 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Casp1P29452 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Casp1P29452 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Casp1P29452 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms