Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Celf1P28659 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Celf1P28659 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Celf1P28659 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Celf1P28659 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Celf1P28659 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Celf1P28659 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Celf1P28659 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Celf1P28659 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Celf1P28659 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Celf1P28659 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Celf1P28659 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Celf1P28659 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Celf1P28659 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Celf1P28659 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Celf1P28659 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Celf1P28659 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Celf1P28659 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Celf1P28659 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Celf1P28659 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Celf1P28659 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Celf1P28659 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Celf1P28659 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Celf1P28659 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Celf1P28659 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Celf1P28659 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Celf1P28659 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Celf1P28659 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Celf1P28659 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Celf1P28659 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Celf1P28659 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Celf1P28659 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Celf1P28659 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Celf1P28659 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Celf1P28659 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Celf1P28659 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Celf1P28659 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Celf1P28659 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Celf1P28659 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Celf1P28659 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Celf1P28659 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Celf1P28659 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Celf1P28659 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Celf1P28659 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Celf1P28659 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms