Protein–RNA interactions for Protein: P28649

Cyp19a1, Aromatase, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp19a1P28649 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cyp19a1P28649 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cyp19a1P28649 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cyp19a1P28649 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp19a1P28649 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp19a1P28649 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp19a1P28649 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp19a1P28649 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp19a1P28649 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp19a1P28649 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cyp19a1P28649 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cyp19a1P28649 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cyp19a1P28649 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cyp19a1P28649 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp19a1P28649 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp19a1P28649 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp19a1P28649 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp19a1P28649 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp19a1P28649 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp19a1P28649 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp19a1P28649 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp19a1P28649 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp19a1P28649 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp19a1P28649 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp19a1P28649 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cyp19a1P28649 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cyp19a1P28649 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp19a1P28649 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp19a1P28649 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp19a1P28649 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp19a1P28649 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp19a1P28649 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp19a1P28649 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp19a1P28649 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp19a1P28649 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp19a1P28649 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp19a1P28649 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp19a1P28649 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp19a1P28649 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp19a1P28649 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp19a1P28649 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp19a1P28649 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyp19a1P28649 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyp19a1P28649 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyp19a1P28649 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp19a1P28649 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp19a1P28649 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.1 ms