Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd8P23463 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd8P23463 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd8P23463 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd8P23463 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd8P23463 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd8P23463 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd8P23463 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd8P23463 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd8P23463 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxd8P23463 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd8P23463 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms