Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prim1P20664 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prim1P20664 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prim1P20664 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prim1P20664 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prim1P20664 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prim1P20664 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prim1P20664 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prim1P20664 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prim1P20664 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prim1P20664 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prim1P20664 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prim1P20664 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms