Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpl13aP19253 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl13aP19253 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl13aP19253 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms