Protein–RNA interactions for Protein: P16056

Met, Hepatocyte growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MetP16056 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MetP16056 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MetP16056 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MetP16056 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MetP16056 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MetP16056 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MetP16056 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MetP16056 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MetP16056 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MetP16056 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MetP16056 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MetP16056 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MetP16056 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MetP16056 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MetP16056 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MetP16056 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MetP16056 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MetP16056 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MetP16056 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MetP16056 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MetP16056 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MetP16056 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MetP16056 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MetP16056 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MetP16056 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MetP16056 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MetP16056 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MetP16056 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MetP16056 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MetP16056 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MetP16056 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MetP16056 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MetP16056 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MetP16056 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MetP16056 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MetP16056 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MetP16056 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MetP16056 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MetP16056 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MetP16056 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MetP16056 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MetP16056 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MetP16056 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MetP16056 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MetP16056 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MetP16056 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MetP16056 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MetP16056 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MetP16056 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MetP16056 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MetP16056 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MetP16056 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MetP16056 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MetP16056 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MetP16056 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MetP16056 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MetP16056 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MetP16056 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MetP16056 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MetP16056 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MetP16056 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MetP16056 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MetP16056 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MetP16056 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MetP16056 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MetP16056 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MetP16056 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MetP16056 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MetP16056 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MetP16056 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MetP16056 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MetP16056 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MetP16056 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MetP16056 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MetP16056 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MetP16056 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MetP16056 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MetP16056 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MetP16056 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MetP16056 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MetP16056 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MetP16056 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MetP16056 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MetP16056 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MetP16056 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MetP16056 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MetP16056 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MetP16056 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MetP16056 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MetP16056 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MetP16056 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MetP16056 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MetP16056 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MetP16056 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MetP16056 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MetP16056 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MetP16056 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MetP16056 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MetP16056 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MetP16056 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.6 ms