Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NclP09405 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NclP09405 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NclP09405 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NclP09405 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NclP09405 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NclP09405 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NclP09405 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NclP09405 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NclP09405 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NclP09405 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NclP09405 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NclP09405 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NclP09405 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NclP09405 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NclP09405 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NclP09405 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NclP09405 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NclP09405 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NclP09405 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NclP09405 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NclP09405 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NclP09405 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NclP09405 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NclP09405 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NclP09405 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NclP09405 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NclP09405 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NclP09405 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NclP09405 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NclP09405 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NclP09405 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NclP09405 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NclP09405 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NclP09405 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NclP09405 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NclP09405 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NclP09405 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NclP09405 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NclP09405 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NclP09405 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NclP09405 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NclP09405 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NclP09405 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NclP09405 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NclP09405 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NclP09405 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NclP09405 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
NclP09405 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NclP09405 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NclP09405 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NclP09405 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NclP09405 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NclP09405 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NclP09405 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NclP09405 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NclP09405 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NclP09405 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NclP09405 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NclP09405 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NclP09405 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NclP09405 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NclP09405 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NclP09405 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NclP09405 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NclP09405 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NclP09405 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NclP09405 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NclP09405 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NclP09405 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NclP09405 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NclP09405 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NclP09405 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NclP09405 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NclP09405 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NclP09405 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NclP09405 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NclP09405 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NclP09405 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NclP09405 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NclP09405 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NclP09405 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NclP09405 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NclP09405 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NclP09405 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NclP09405 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NclP09405 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NclP09405 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NclP09405 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NclP09405 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NclP09405 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NclP09405 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NclP09405 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NclP09405 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NclP09405 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NclP09405 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NclP09405 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NclP09405 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NclP09405 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NclP09405 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms