Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifna6P07350 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifna6P07350 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna6P07350 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms