Protein–RNA interactions for Protein: P06909

Cfh, Complement factor H, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfhP06909 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CfhP06909 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CfhP06909 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CfhP06909 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CfhP06909 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CfhP06909 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CfhP06909 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CfhP06909 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CfhP06909 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CfhP06909 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CfhP06909 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CfhP06909 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CfhP06909 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CfhP06909 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CfhP06909 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CfhP06909 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CfhP06909 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CfhP06909 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CfhP06909 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CfhP06909 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CfhP06909 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CfhP06909 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CfhP06909 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CfhP06909 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CfhP06909 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CfhP06909 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CfhP06909 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CfhP06909 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CfhP06909 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CfhP06909 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CfhP06909 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CfhP06909 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CfhP06909 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CfhP06909 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CfhP06909 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CfhP06909 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CfhP06909 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CfhP06909 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CfhP06909 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CfhP06909 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CfhP06909 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CfhP06909 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CfhP06909 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CfhP06909 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CfhP06909 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CfhP06909 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CfhP06909 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CfhP06909 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CfhP06909 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CfhP06909 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CfhP06909 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CfhP06909 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CfhP06909 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CfhP06909 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CfhP06909 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CfhP06909 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CfhP06909 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CfhP06909 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CfhP06909 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CfhP06909 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CfhP06909 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CfhP06909 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CfhP06909 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CfhP06909 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CfhP06909 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CfhP06909 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CfhP06909 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CfhP06909 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CfhP06909 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CfhP06909 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CfhP06909 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CfhP06909 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CfhP06909 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CfhP06909 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CfhP06909 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CfhP06909 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CfhP06909 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CfhP06909 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CfhP06909 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CfhP06909 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CfhP06909 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CfhP06909 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CfhP06909 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CfhP06909 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CfhP06909 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CfhP06909 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CfhP06909 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CfhP06909 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CfhP06909 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CfhP06909 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CfhP06909 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CfhP06909 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CfhP06909 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CfhP06909 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CfhP06909 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CfhP06909 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CfhP06909 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CfhP06909 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CfhP06909 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CfhP06909 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms