Protein–RNA interactions for Protein: P06797

Ctsl, Cathepsin L1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtslP06797 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtslP06797 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtslP06797 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtslP06797 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtslP06797 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtslP06797 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtslP06797 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtslP06797 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtslP06797 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtslP06797 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtslP06797 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtslP06797 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtslP06797 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtslP06797 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtslP06797 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtslP06797 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtslP06797 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtslP06797 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtslP06797 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtslP06797 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtslP06797 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtslP06797 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtslP06797 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CtslP06797 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CtslP06797 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtslP06797 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtslP06797 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CtslP06797 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtslP06797 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtslP06797 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtslP06797 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtslP06797 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtslP06797 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtslP06797 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtslP06797 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtslP06797 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtslP06797 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtslP06797 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtslP06797 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtslP06797 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtslP06797 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtslP06797 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CtslP06797 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtslP06797 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtslP06797 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtslP06797 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtslP06797 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtslP06797 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtslP06797 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtslP06797 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtslP06797 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtslP06797 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CtslP06797 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtslP06797 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtslP06797 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtslP06797 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtslP06797 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtslP06797 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtslP06797 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtslP06797 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtslP06797 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtslP06797 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtslP06797 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtslP06797 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtslP06797 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtslP06797 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtslP06797 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtslP06797 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtslP06797 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CtslP06797 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtslP06797 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CtslP06797 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtslP06797 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtslP06797 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtslP06797 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtslP06797 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CtslP06797 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtslP06797 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtslP06797 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtslP06797 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtslP06797 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtslP06797 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtslP06797 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtslP06797 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtslP06797 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtslP06797 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtslP06797 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtslP06797 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtslP06797 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtslP06797 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtslP06797 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtslP06797 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtslP06797 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtslP06797 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtslP06797 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtslP06797 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtslP06797 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtslP06797 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtslP06797 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtslP06797 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms