Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DcxO88809 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DcxO88809 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DcxO88809 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DcxO88809 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DcxO88809 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DcxO88809 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DcxO88809 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DcxO88809 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DcxO88809 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DcxO88809 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DcxO88809 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DcxO88809 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DcxO88809 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DcxO88809 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DcxO88809 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DcxO88809 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DcxO88809 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DcxO88809 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DcxO88809 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DcxO88809 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DcxO88809 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DcxO88809 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DcxO88809 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DcxO88809 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DcxO88809 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DcxO88809 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DcxO88809 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DcxO88809 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DcxO88809 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DcxO88809 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DcxO88809 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DcxO88809 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DcxO88809 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DcxO88809 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DcxO88809 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DcxO88809 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DcxO88809 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DcxO88809 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DcxO88809 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DcxO88809 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DcxO88809 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DcxO88809 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DcxO88809 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DcxO88809 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DcxO88809 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DcxO88809 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DcxO88809 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DcxO88809 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DcxO88809 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DcxO88809 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DcxO88809 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DcxO88809 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DcxO88809 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DcxO88809 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DcxO88809 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DcxO88809 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DcxO88809 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DcxO88809 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DcxO88809 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DcxO88809 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DcxO88809 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DcxO88809 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DcxO88809 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DcxO88809 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DcxO88809 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DcxO88809 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DcxO88809 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DcxO88809 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DcxO88809 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DcxO88809 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DcxO88809 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DcxO88809 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DcxO88809 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DcxO88809 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DcxO88809 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DcxO88809 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DcxO88809 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DcxO88809 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DcxO88809 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DcxO88809 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DcxO88809 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DcxO88809 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DcxO88809 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DcxO88809 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DcxO88809 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DcxO88809 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DcxO88809 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DcxO88809 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DcxO88809 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DcxO88809 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DcxO88809 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DcxO88809 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DcxO88809 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DcxO88809 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DcxO88809 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DcxO88809 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DcxO88809 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DcxO88809 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DcxO88809 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms