Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hcn4O70507 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcn4O70507 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hcn4O70507 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hcn4O70507 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hcn4O70507 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms