Protein–RNA interactions for Protein: O70421

Fzd1, Frizzled-1, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd1O70421 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fzd1O70421 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fzd1O70421 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fzd1O70421 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fzd1O70421 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fzd1O70421 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fzd1O70421 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fzd1O70421 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms