Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Copb2O55029 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Copb2O55029 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Copb2O55029 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Copb2O55029 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Copb2O55029 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Copb2O55029 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Copb2O55029 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Copb2O55029 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Copb2O55029 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Copb2O55029 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms