Protein–RNA interactions for Protein: O54774

Ap3d1, AP-3 complex subunit delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3d1O54774 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ap3d1O54774 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3d1O54774 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3d1O54774 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms