Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Timm44O35857 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Timm44O35857 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Timm44O35857 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Timm44O35857 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Timm44O35857 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Timm44O35857 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Timm44O35857 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Timm44O35857 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Timm44O35857 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Timm44O35857 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Timm44O35857 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Timm44O35857 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Timm44O35857 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms