Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chil3O35744 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chil3O35744 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chil3O35744 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chil3O35744 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chil3O35744 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chil3O35744 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms