Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn2r88L7N1W8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r88L7N1W8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r88L7N1W8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r88L7N1W8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r88L7N1W8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r88L7N1W8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r88L7N1W8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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