Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Taf4bG5E8Z2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Taf4bG5E8Z2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf4bG5E8Z2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf4bG5E8Z2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms