Protein–RNA interactions for Protein: G5E8S3

E230025N22Rik, Riken cDNA E230025N22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E230025N22RikG5E8S3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E230025N22RikG5E8S3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
E230025N22RikG5E8S3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E230025N22RikG5E8S3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms