Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Pcf11G3X9Z4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pcf11G3X9Z4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pcf11G3X9Z4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pcf11G3X9Z4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pcf11G3X9Z4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pcf11G3X9Z4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Pcf11G3X9Z4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pcf11G3X9Z4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Pcf11G3X9Z4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Pcf11G3X9Z4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Pcf11G3X9Z4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Pcf11G3X9Z4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Pcf11G3X9Z4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pcf11G3X9Z4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pcf11G3X9Z4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pcf11G3X9Z4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Pcf11G3X9Z4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Pcf11G3X9Z4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pcf11G3X9Z4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pcf11G3X9Z4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Pcf11G3X9Z4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Pcf11G3X9Z4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Pcf11G3X9Z4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pcf11G3X9Z4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pcf11G3X9Z4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pcf11G3X9Z4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pcf11G3X9Z4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pcf11G3X9Z4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pcf11G3X9Z4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pcf11G3X9Z4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pcf11G3X9Z4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Pcf11G3X9Z4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pcf11G3X9Z4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Pcf11G3X9Z4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pcf11G3X9Z4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pcf11G3X9Z4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Pcf11G3X9Z4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Pcf11G3X9Z4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Pcf11G3X9Z4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pcf11G3X9Z4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pcf11G3X9Z4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pcf11G3X9Z4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pcf11G3X9Z4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pcf11G3X9Z4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Pcf11G3X9Z4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.6 ms