Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccl26F8VQM2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccl26F8VQM2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccl26F8VQM2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccl26F8VQM2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccl26F8VQM2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccl26F8VQM2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccl26F8VQM2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccl26F8VQM2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccl26F8VQM2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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