Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Speer4aF8VPX6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Speer4aF8VPX6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Speer4aF8VPX6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Speer4aF8VPX6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Speer4aF8VPX6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Speer4aF8VPX6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Speer4aF8VPX6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Speer4aF8VPX6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Speer4aF8VPX6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Speer4aF8VPX6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Speer4aF8VPX6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Speer4aF8VPX6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Speer4aF8VPX6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Speer4aF8VPX6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Speer4aF8VPX6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4aF8VPX6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4aF8VPX6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4aF8VPX6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4aF8VPX6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Speer4aF8VPX6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4aF8VPX6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4aF8VPX6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms