Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pagr1bF6V0H0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pagr1bF6V0H0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pagr1bF6V0H0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Pagr1bF6V0H0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pagr1bF6V0H0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Pagr1bF6V0H0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pagr1bF6V0H0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pagr1bF6V0H0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pagr1bF6V0H0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pagr1bF6V0H0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pagr1bF6V0H0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pagr1bF6V0H0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pagr1bF6V0H0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pagr1bF6V0H0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pagr1bF6V0H0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pagr1bF6V0H0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pagr1bF6V0H0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms